6月17日，由江西省教育厅、省公安厅、省国资委、省市场监督管理局组成的联合调查组，对外通报了江西工业职业技术学院“食堂吃出疑似鼠头”事件的调查情况。
一周前的6月10日，省级联合调查组宣告成立。最新通报称，联合调查组经勘察现场，调取监控视频发现，6月1日，学生在食堂吃出疑似为“鼠头”的异物，被涉事食堂工作人员事发当日丢弃。通过查看食堂后厨视频，查阅采购清单，询问涉事食堂负责人、后厨相关当事人、当事学生和现场围观学生等，判定异物不是鸭脖。根据国内权威动物专家对提取的当事学生所拍现场照片和视频进行专业辨识，判定异物为老鼠类啮齿动物的头部。
联合调查组指出，南昌高新区市场监督管理局昌东分局、江西工业职业技术学院未认真调查取证，发布“异物为鸭脖”结论是错误的。
此前的6月3日，涉事高校江西工业职业技术学院曾通过官方微博率先作出回应。
据校方当时的通报，有关视频拍摄地点确实在该校食堂，但当事学生本人在事发当时即邀请同学共同对“异物”进行了比对，确认“异物”为鸭脖，为正常食物。该学生已现场作出书面说明，对视频内容进行澄清。通报还称，南昌市高新区市场监督管理局接到情况报告后，第一时间派出执法人员到学院开展调查，问询学校工作人员、食堂负责人、当事学生及相关知情人，对食品留样进行采样检测。
而在江西广播电视台《都市现场》栏目6月3日发布的报道中，南昌市高新区市场监督管理局昌东分局局长江协学介绍，执法人员第一时间赶到现场，反复对比，确认这个异物就是鸭脖。视频画面显示，江协学等人是拿着图片进行的比对。早前作出回应的还有南昌市市场监督管理局。据@西部决策 6月4日报道，该局一名工作人员表示，可能吃的时候看那个东西有点像，经过核实，它确实是一个鸭脖。同在6月4日，央广网发自南昌的报道称，当天，记者通过走访了解到，事发现场，高新区市场监管局相关人员通过查看当事人拍摄的图片进行比对，初步判定系鸭脖。
另外在6月5日，南昌市市场监督管理局一名工作人员曾向澎湃新闻表示，这件事是昌东分局处理的，“像这种的我们按照标准来检测，他们可能是用了一些其他的方法吧”。
在多方回应下，舆论场依然沸沸扬扬，不少网友质疑“指鼠为鸭”。
对异物的检测结果为何引发公众质疑？华龙网和潮新闻的评论文章颇具代表性。
华龙网文章指出，检测结果并没有就视频中的细节进行解析，只是单向输出检测结果显然不适用于所有情况，最终可能会陷入说真话也无人相信的窘境。相关部门完全可以利用更细节更具有针对性的方式，解释视觉中的“牙齿”“胡须”究竟为何物。
潮新闻文章认为，学校应该先固定证据，找第三方调查公布结论，才能让人心服口服。可学校为了尽快平息舆论，自己先通报得出结果，还拉着当事学生一起表态，这就把整个事情的顺序搞反了。另外，整个过程没有一步步展示给大家看，没有完整的证据链条，怀疑送检物事前被调包或是别的什么手段，也属正常。
此后，又有专家发声质疑。例如，上游新闻记者6月6日从一位啮齿类动物研究专家处了解到，如果图片没有作假，那么80%（概率）可以确定是小鼠头部。这名专家从事啮齿类动物研究30多年，在他看来，“新闻里有一个正面的图，它有鼠的犬齿，特别是下面犬齿很长，它会生长，如果图片没有造假，我觉得那就是鼠头，如果是鸭脖的话，它不会有那种白色的东西。”他还提到，“啮齿动物的头骨，特别是它的两颗牙，它的上牙短，下牙很长，这个是很明显的。因为它终身都会长，不会像人类牙齿，长到一定长度就不长了 。”澎湃新闻注意到，6月17日午间，江西工业职业技术学院官微已删除了此前发布的落款为学院后勤管理处的《情况通报》。
根据联合调查组最新通报，经认定，江西工业职业技术学院对此次事件负主体责任，涉事企业负直接责任，市场监督管理部门负监管责任。
目前，依据《中华人民共和国食品安全法》及其实施条例，南昌市市场监督管理局已吊销涉事食堂食品经营许可证，对涉事企业和法定代表人顶格处罚。下一步，将依法依规严肃处理江西工业职业技术学院、南昌高新区市场监督管理局昌东分局等相关责任单位、涉事企业和责任人，并在全省开展食品安全专项整治，抓好源头治理，切实保障人民群众食品安全。
